無料でPythonの実行環境を使わせてもらえるGoogle Colaboratory（以下、Colab）。現在の無料枠でも、T4やL4などの高性能なGPU、約12GB〜16GBのメモリ、そして100GB前後のディスクスペースが利用できる強力な環境であり、手元のPCよりハイスペックな人も多いだろう。 データサイエンスの分野ではPythonが主流である一方で、Rユーザにとっては「PythonだけでなくRでも使えたらいいのに」と思うところである。実は、Colabのインスタンスには標準でRの環境が用意されており、用途に応じて複数のアプローチでRを利用することができる。この記事では、最新環境に合わせてColabでRを使い倒す方法と、その高速化 …

クラスター分析は 距離行列の生成（類似度行列ではない！） クラスタリングの実行 という流れになる。 それぞれのステップで、採用する 距離の種類 クラスタリングの方法 がチューニング変数となる。 この順に手順を見ていく。 行数、列数の多いビッグデータ向きのデータ形式であるMatrixパッケージに対応した距離行列についても説明する。 距離行列を生成する 類似度行列ではなく距離行列を作る。similarityではなくdistanceを作る。 直感的にはデータから距離の指標（どれだけ離れているか）ではなく類似度（どれだけ近いか）の指標を抽出し、そこからクラスタリングしたいケースが多いのだが、あくまで類似度指標に基づいた距離行列を生成するので …